Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pramef12Q9D2F1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms