Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Shmt2Q9CZN7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Shmt2Q9CZN7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Shmt2Q9CZN7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Shmt2Q9CZN7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Shmt2Q9CZN7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Shmt2Q9CZN7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shmt2Q9CZN7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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