Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dnajc18Q9CZJ9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms