Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Mis18aQ9CZJ6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mis18aQ9CZJ6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms