Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp11Q9CZJ1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms