Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc77Q9CZH8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc77Q9CZH8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc77Q9CZH8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc77Q9CZH8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc77Q9CZH8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc77Q9CZH8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc77Q9CZH8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc77Q9CZH8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc77Q9CZH8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc77Q9CZH8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccdc77Q9CZH8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccdc77Q9CZH8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc77Q9CZH8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccdc77Q9CZH8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Ccdc77Q9CZH8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc77Q9CZH8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc77Q9CZH8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc77Q9CZH8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc77Q9CZH8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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