Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prdm5Q9CXE0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms