Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpusd4Q9CWX4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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