Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Malsu1Q9CWV0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms