Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9CWU4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q9CWU4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms