Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2310003L06RikQ9CV82 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
2310003L06RikQ9CV82 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms