Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fcf1Q9CTH6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Fcf1Q9CTH6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Fcf1Q9CTH6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fcf1Q9CTH6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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