Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg12Q9CQY1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg12Q9CQY1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms