Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PompQ9CQT5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PompQ9CQT5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms