Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PsenenQ9CQR7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms