Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9CQM1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9CQM1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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