Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mrpl35Q9CQL6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mrpl35Q9CQL6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl35Q9CQL6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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