Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znhit3Q9CQK1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms