Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Higd2aQ9CQJ1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Higd2aQ9CQJ1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms