Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sar1bQ9CQC9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms