Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Chmp3Q9CQ10 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms