Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccdc198Q9CPZ1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc198Q9CPZ1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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