Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Abcg3Q99P81 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms