Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf2ird2Q99NI3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf2ird2Q99NI3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms