Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Nus1Q99LJ8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Nus1Q99LJ8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Nus1Q99LJ8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nus1Q99LJ8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nus1Q99LJ8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nus1Q99LJ8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nus1Q99LJ8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nus1Q99LJ8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nus1Q99LJ8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nus1Q99LJ8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Nus1Q99LJ8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Nus1Q99LJ8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nus1Q99LJ8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nus1Q99LJ8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Nus1Q99LJ8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms