Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms