Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cstf3Q99LI7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cstf3Q99LI7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms