Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Sh3bp5lQ99LH9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Sh3bp5lQ99LH9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sh3bp5lQ99LH9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sh3bp5lQ99LH9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sh3bp5lQ99LH9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Sh3bp5lQ99LH9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Sh3bp5lQ99LH9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Sh3bp5lQ99LH9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp5lQ99LH9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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