Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lysmd3Q99LE3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lysmd3Q99LE3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lysmd3Q99LE3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lysmd3Q99LE3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lysmd3Q99LE3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lysmd3Q99LE3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lysmd3Q99LE3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lysmd3Q99LE3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lysmd3Q99LE3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lysmd3Q99LE3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lysmd3Q99LE3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms