Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf34Q99KR6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf34Q99KR6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms