Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab28Q99KL7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab28Q99KL7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms