Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hps4Q99KG7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hps4Q99KG7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms