Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dok4Q99KE3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dok4Q99KE3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms