Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlgn1Q99K10 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms