Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pacsin3Q99JB8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms