Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tspan1Q99J59 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tspan1Q99J59 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms