Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf3Q922U1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf3Q922U1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms