Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Clip1Q922J3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clip1Q922J3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms