Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tubb6Q922F4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb6Q922F4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms