Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grin3bQ91ZU9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grin3bQ91ZU9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms