Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpm2Q91YD4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpm2Q91YD4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms