Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp3Q91W36 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms