Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms