Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rprd1aQ8VDS4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rprd1aQ8VDS4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms