Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops8Q8VBV7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops8Q8VBV7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms