Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slf1Q8R3P9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms