Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CipcQ8R0W1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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