Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc137Q8R0K4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms