Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hoxc12Q8K5B8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc12Q8K5B8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc12Q8K5B8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms