Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Treml1Q8K558 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms